As indicações para a simpatectomia lombar são limitadas essencialmente para doentes com doença arterial obstrutiva ou distúrbios vasomotores da perna e do pé.

Os efeitos fisiológicos de uma simpatectomia lombar, apesar do longo uso clínico, ainda permanecem mal definidos. A interpretação do aumento do fluxo sanguíneo tem sido questionada.

A neuralgia pós simpatectomia lombar é relativamente frequente, e sua natureza ainda não está totalmente esclarecida.

As indicações mais comuns nas simpatectomias cervicotorácicas são: síndrome vaso espástica, doenças orgânicas, como tromboangeíte obliterante, síndrome de compressão nervovascular cervicobraquial.

A remoção unilateral de L1 em homens pode resultar na perda de libido, no entanto falha da ejaculação é menos esclarecida.