mutações do gene TREX-1 podem determinar o aparecimento de LES, uma vez que permitem que o RNA celular não degradado estimule o sistema imune inato a produzir interferon tipo II.

a deficiência de C2 é a disfunção do complemento mais comum, sendo a principal alteração relacionada com o surgimento da doença.

a metilação anormal das células T tem forte associação com o surgimento do LES e da exacerbação de atividade inflamatória, ao longo de sua evolução.

apesar de mais frequente em mulheres, a doença não apresenta maior prevalência em homens com síndrome de Klinefelter (47, XXY), quando comparados com homens normais (46, XY).

vários estudos demonstram a forte associação genética da doença, entretanto irmãos gêmeos monozigóticos e dizigóticos têm, praticamente, igual probabilidade de desenvolver a doença, ao longo de suas vidas.