A t(12;21) confere o transcrito bcr-abl, que indica mau prognóstico. Paciente deve receber transplante de medula óssea em primeira remissão clínica completa.

Deve-se verificar o peso molecular das proteínas quiméricas, pois é possível diferenciar a leucemia linfoide aguda de uma leucemia linfoide crônica em fase blástica.

Mesmo sendo uma translocação de mau prognóstico, a positividade ao CD10 confere maior sensibilidade à quimioterapia neste caso.

A t(12;21) confere, excepcionalmente, um bom prognóstico em crianças com LLA. Está associada ao imunofenótipo precursor de células B, sendo encontrada em cerca de 30% dos casos pediátricos e apenas 3% dos adultos.

A t(12;21) pode conferir prognóstico variável, dependendo da morfologia dos blastos.