Nas florestas, a formação de banco de sementes geralmente ocorre em espécies de sucessão inicial ou de clareiras, tais como ervas, arbustos e árvores pioneiras, embora seja ocasionalmente também encontrada em sementes de espécies de sucessão avançada.

Nos ecossistemas fechados de florestas tropicais, quando as sementes saem do banco e são trazidas à superfície na abertura de clareiras, elas são expostas a outras condições ambientais de luz e temperatura, que podem promover a germinação das mesmas.

A recolonização da vegetação em um ambiente perturbado ocorre principalmente através de banco de sementes no solo, mantendo este um papel fundamental no equilíbrio dinâmico da área.

Beira de rio e lagos apresentam sementes de depleção, com capacidade de germinação e crescimento lento, capazes de impedir a erosão destas áreas e o consequente assoreamento destes ecossistemas.

Áreas que apresentam perturbações frequentes apresentam bancos de semente adaptados aos tipos de perturbações sofridos. Ecossistemas de Cerrado, que sofrem incêndios frequentes, apresentam sementes enterradas no solo com grande capacidade de germinação após o fogo.