A metodologia de extração de DNA utilizando beads magnéticas é a única recomendada para uso em tecido parafinado.

O DNA extraído de tecido parafinado não precisa ser quantificado antes de seu uso na técnica de sequenciamento de nova geração.

No contexto da investigação de alterações somáticas, a amostra tumoral deve ser previamente avaliada para adequada dissecção da fração com presença de neoplasia, a fim de evitar contaminação com células não neoplásicas.

O DNA deve ser extraído sempre em processos realizados sob refrigeração, devido à labilidade deste ácido nucleico.

A etapa de eluição não influencia a concentração de DNA que será obtida ao final da extração quando se trata de tecido parafinado.