Após um período de incubação médio de 5 a 14 dias, a infecção por leptospira resulta em infecção subclínica, doença febril indiferenciada ou Doença de Weil.

90% dos casos descritos na literatura são da forma ictérica.

É uma doença bifásica: Leptospirosemia com duração de 3 a 10 dias, caracterizada por febre, seguida de defervescência por 1 a 2 dias e a fase imune, com recrudescência da febre e outros sintomas.

Doença de Weil é a forma grave de Leptospirose associada a disfunção hepática, disfunção renal, fenômenos hemorrágicos e alterações hemodinâmicas, pulmonares e da consciência.

Importante considerar como diagnóstico diferencial Hepatites virais agudas, Arboviroses (Dengue e Febre Amarela), Malária, Hantavirose, Febre tifoide, Endocardite.