A desinfecção de alto nível deve destruir bactérias vegetativas, bacilo da tuberculose e fungos, entretanto, não elimina esporos.

Quando um produto para a saúde vai passar por um processo de desinfecção, não há necessidade de realização de limpeza prévia.

O ácido peracético tem boa eficácia como desinfetante, mas apresenta a desvantagem de produzir resíduos de alta toxicidade.

Em caso de contaminação bacteriana, utiliza-se hipoclorito de sódio a 1%, substância indicada exclusivamente para desinfecção de contaminações de baixo nível.

A solução de glutaraldeído a 2% tem boa eficácia como desinfetante, entretanto não deve ser utilizado na desinfecção de materiais de assistência ventilatória pelo risco de causar irritação das vias aéreas.