Na preparação do couro a ser analisado por microscopia eletrônica de varredura, deve-se lavar a amostra com tampão cacodilato, fixá-la com Karnovsky e, em seguida, colocá-la em solução de ósmio a 20%.

O microscópio eletrônico de varredura se apresenta como recurso de grande versatilidade, para o estudo da pele, pois a interação entre os elétrons incidentes e os átomos das amostras coletadas ocorre pelo fenômeno do espalhamento elástico.

A estrutura do colágeno pode ser caracterizada por diferentes técnicas de microscopia, entre elas, a de força atômica, a de transmissão eletrônica, a de varredura e a difração de raios X.

Na preparação do material a ser analisado por microscopia de transmissão, deve-se utilizar o mesmo procedimento da microscopia de varredura, com o emprego de solução de ósmio a 1%, não devendo submeter o material a processo de metalização com ouro.

A detecção de elétrons secundários no material analisado guarda relação de dependência com o número atômico e a energia dos elétrons, dado importante no estudo das propriedades físicas da pele.