controle da União: embora apresente as vantagens de um planejamento centralizado, em termos de maior racionalidade de investimento, disponibilização de recursos e da adequação do sistema tarifário, tende a gerar ineficiências em razão da complexidade administrativa – envolvendo departamentos de vários ministérios, das influências da eventual falta de competição.

controle dos estados e municípios: a eventual concorrência entre portos estaduais ou municipais pode induzir ao aumento da eficiência, mas também conduzir à alocação ineficiente de investimentos públicos.

controle de autoridades autônomas: as autoridades portuárias são constituídas por membros eleitos ou indicados por Conselho de Autoridade Portuária de usuários e operadores, com as funções básicas de regular, fiscalizar e explorar, elaborando o Plano de Desenvolvimento e Zoneamento – PDZ.

controle privado: nos terminais privativos, os portos estão associados a outras atividades industriais ou de transporte para atender às necessidades de um grupo de empreendimentos industrial local, com gerenciamento flexível e voltado para a maximização dos lucros.