A indicação da genotipagem pré-tratamento em pessoa vivendo com HIV ou AIDS baseia-se na relação de custo-efetividade do teste, de acordo com a prevalência da resistência primária ou transmitida do HIV-1 na população. De acordo com o Protocolo Clínico e Diretrizes Terapêuticas para Manejo da Infecção pelo HIV em Adultos, do Ministério da Saúde, em pessoa vivendo com HIV ou AIDS virgem de tratamento com terapia antirretroviral, recomenda-se a realização de rotina de genotipagem pré-tratamento nas seguintes situações, EXCETO em: