Uma parte importante que deve ser considerada pelo laboratório quando trabalhando com micobactérias é a segurança empregada na manipulação do material clínico destas cepas. É grande o número de casos de técnicos infectados por descaso dos laboratórios com a manipulação deste tipo de patógeno.

Em relação à pesquisa de bacilos álcool-ácido resistentes no material clínico, sem tratamento (laboratório de Nível-1), as seguintes medidas devem ser observadas com exceção da alternativa: