a setorização é tão-somente para garantir a compartimentação das atividades, de modo a minimizar as possibilidades de contaminação cruzada. Assim, atividades afins, mesmo que de etapas diferentes dentro de um fluxograma, podem ser realizadas na mesma sala.

a setorização deve ser planejada para nunca dificultar o fluxo de trabalho. Assim, as salas não devem ser muito pequenas (subdimensionadas) para a execução das atividades, nem grandes demais (superdimensionadas).

o contato principal da agroindústria com o meio externo pode ser realizado através da entrada principal, sem a exigência de antessala e não deve ter espaços separados para lavagem de botas e sanitização de mãos.

não deve existir a presença de portas e janelas de vestiários e sanitários voltadas para qualquer dependência interna da agroindústria, incluindo a área de recepção e expedição de matéria-prima e produto acabado, respectivamente. Isso se justifica pelo fato de que a contaminação ambiental dos vestiários e sanitários pode contaminar o ambiente interno de processamento da agroindústria.

a agroindústria deve ter dois banheiros, um masculino e um feminino, por exigência de Norma Regulamentadora trabalhista (NR 24, item 24.1.2.1)