Para a coleta de escarro expectorado, os pacientes podem escovar os dentes e gargarejar com água, imediatamente antes de se obter a amostra.

Devem ser obtidas amostras de escarro logo após acordar, pois elas contêm secreções acumuladas durante a noite, nas quais as bactérias patogênicas provavelmente estarão mais concentradas.

O padrão-ouro para o diagnóstico da faringite estreptocócica é a cultura bacteriana em ágar sangue de carneiro.

Uma das causas virais mais comuns de faringite viral é o vírus Epstein-Barr e seu diagnóstico é sorológico.