Produtos não estéreis são aqueles nos quais se admite conceitualmente a presença de carga microbiana, embora limitada, tendo em vista as características de sua utilização. O objetivo imediato do controle de qualidade é comprovar a ausência de microrganismos patogênicos e determinar o número de microrganismos viáveis, em função dos tipos de utilização do produto.

Nas análises microbiológicas a serem feitas para produtos acabados, devem-se seguir os métodos de filtração; os métodos de inoculação direta só podem ser usados para produtos em que o número de colônias não ultrapasse 100 por placa.

As amostras devem ser preparadas conforme descrito nos compêndios oficiais, respeitando as características físico-químicas do produto a ser testado. O número de amostras a serem testadas é pré-determinado em 1% de cada lote.

Durante muitos anos, conforme algumas orientações de compêndios oficiais e citações técnicas mais aceitas, os microrganismos a serem pesquisados em razão da aceitação de sua presença em produtos acabados, mesmo que apenas em quantidades que não sejam suficientes para causar danos à saúde do consumidor, foram: Staphylococus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus cereus, Clostridium tetani.