As principais pragas da soja seria a lagarta da soja (Anticarsia gemmatalis) que ataca as folhas, a lagarta falsa medideira (Chrysodeixis includens) que ataca folhas, o percevejo marrom (Euschistus heros) que ataca vagens e grãos.

A lagarta falsa medideira (Chrysodeixis includens) não representa nenhuma dificuldade de controle em relação a lagarta da soja (Anticarsia gemmatalis), pois todo inseticida eficaz para a lagarta da soja é também para o controle da falsa medideira, além desta última ficar mais exposta aos inseticidas.

O controle da lagarta da soja (Anticarsia gemmatalis) é muito difícil, por isso é necessário aplicar inseticidas preventivamente de amplo espectro de ação e com baixa seletividade.

O percevejo marrom (Euschistus heros) é de controle relativamente fácil e podendo ser utilizado o controle biológico com o Bacillus thuringiensis.