todas estas novas tecnologias têm como princípio tecnológico a hibridização com sondas de ácidos nucleicos.

a alta taxa de erros de sequenciamento de DNA de todos estes novos métodos inviabiliza sua utilização para sequenciamento de novos genomas.

o alto preço por base de DNA sequenciada dos novos métodos de sequenciamento é compensado pela geração de fragmentos de DNA de grande tamanho, sendo estes fragmentos obtidos pela tecnologia de sequenciamento por síntese (Illumina).

os sequenciamentos obtidos pela tecnologia PacBio são pequenos fragmentos de DNA, ou seja, menores que 100 nucleotídeos, mas com baixa taxa de erro.

a principal vantagem dos novos métodos de sequenciamento de DNA é a possibilidade de obtenção de milhões de sequências de DNA diferentes simultaneamente a partir de uma única corrida ou reação, ao contrário do tradicional de Sanger, no qual uma única sequência de DNA pode ser obtida por sequenciamento por capilar.