O conhecimento das relações entre estrutura molecular e propriedades físicas permite a previsão dessas propriedades para diferentes compostos, o que pode determinar, por exemplo, a escolha de um solvente para uma certa aplicação. O ponto de ebulição, por exemplo, depende das forças atrativas que existem entre as moléculas de um composto e essas forças, por sua vez, são determinadas pela própria estrutura do composto. Se as forças que mantêm as moléculas unidas no estado líquido forem fortes, muita energia será necessária para separar essas moléculas e o ponto de ebulição da substância será alto.