Na conjuntivite neonatal, a N. gonorrhoeae é mais frequente na primeira semana, enquanto a C. trachomatis é mais frequente entre a primeira e terceira semanas de vida.

As conjuntivites por adenovírus se caracterizam por hiperemia conjuntival significativa sem reação folicular e acompanhada de linfadenopatia pré-auricular, hemorragias conjuntivais, membranas e pseudomembranas.

A linfadenopatia pré-auricular é achado comum nas conjuntivites por S. pneumoniae e S. aureus.

A conjuntivite gonocócica está associada a úlceras profundas de localização preferencialmente central, esclerite anterior, necrose escleral, melting corneano e elevação da pressão intraocular.