as fezes devem ser coletadas durante a fase crônica, antes de iniciar o tratamento com antibióticos. Em pacientes com infecção latente, do mesmo modo que para crianças ou indivíduos com dificuldade de obtenção de amostras, deve ser priorizada a utilização de swabs retais.

a pesquisa de Salmonella Typhi nas fezes, em pacientes com suspeita de febre tifoide, é indicada nos primeiros três dias da doença.

a amostra, para realização do hemocultivo, deve ser coletada antes da utilização de antimicrobianos, mas se ressalta que este não é um método de diagnóstico de interesse para febre tifoide e paratifoide, por ser, frequentemente, negativo (cerca de 90% durante a primeira semana de evolução).

a utilização de meios de enriquecimento, nas amostras clínicas, não é necessária se um espécime é apropriadamente obtido na fase aguda da doença, tendo em vista a presença de grande número de células. Contudo, na forma crônica ou mesmo na identificação de portadores, é indicada a utilização de meios de enriquecimento e de meios seletivos para facilitar seu isolamento.