O carbonato de lítio apresenta contra-indicação absoluta no primeiro trimestre de gravidez.

O carbonato de lítio pode ser usado com segurança durante a amamentação, desde que se faça redução da dose até se atingir níveis séricos entre 0,6 e 0,8 meq/l ou se respeite um intervalo mínimo de 8 horas entre a tomada da medicação e a amamentação.

A substituição do carbonato de lítio pela carbamazepina pode reduzir a probabilidade do feto em desenvolver espinha bífida.