Praticamente, todos os produtores desejam possuir empresas bem organizadas. A organização física é a mais aparente e, por isso, tem recebido, nas últimas décadas, maior atenção dos empresários rurais. Nas empresas agropecuárias, esse tipo de organização exige longo tempo e altos investimentos para se materializar, mas, ao final, proporcionam além de ganhos na eficiência produtiva, melhorias de imagem (status) ao empresário rural.

Normalmente, a organização da produção é tão ou mais importante do que a organização das demais áreas administrativas, pois está diretamente ligada ao seguinte aspecto da agricultura: