Várias condições patológicas não-orais têm sido relacionadas ao mau odor oral, incluindo infecção do trato respiratório superior e inferior, o trato gastrintestinal e algumas doenças metabólicas envolvendo os rins e o fígado. Entretanto, levantamentos clínicos demonstraram que mais de 90% de todo mau odor do hálito têm origem na boca. Acredita-se que a massa bacteriana que produz compostos malcheirosos está localizada principalmente na: