Embora possa apresentar padrões variáveis, é pouco provável que um paciente com LES não tenha FAN (anticorpos antinucleares e citoplamáticos) positivos, servindo como teste de triagem.

O C3 e o C4 alterados são encontrados frequentemente em LES e podem identificar pacientes com risco de lesões renais.

O fator reumatoide está presente em muitos pacientes com LES, e a sua identificação indica lesão mais grave da doença.

O anticorpo anti-DNA nativo tem especificidade muito alta para LES, mas a sensibilidade é baixa.