Algumas doenças em bovinos que causam problemas reprodutivos podem ser prevenidos com vacinação, sendo exemplos a vacina contra Rinotraqueíte infecciosa bovina (IBR), Diarréia viral bovina (BVD) e Leptospirose, doenças causadas por vírus e contra a Brucelose, doença causada por bactéria.

Em caprinos e ovinos algumas vacinas são obrigatórias, como a anti-rábica, feita com quatro meses de idade e reforço após 30 dias; contra Clostridioses, realizada aos dois meses de idade e reforço após 30 dias e contra a Febre aftosa, realizada aos seis meses de idade.

Existem muitas vacinas disponíveis, sendo que a avaliação individual da granja e dos riscos e perdas econômicas irão definir o programa básico de vacinação. São exemplos de algumas vacinas que podem ser utilizadas em granjas suínas a vacina contra Erisipela; Parvovirose; Leptospirose; Colibacilose; Clostridiose; Rinite atrófica e Pneumonia enzoótica.

Uma das respostas imunológicas diante de um organismo estranho é a resposta humoral, onde o organismo estranho estimula os linfócitos circulatórios (glóbulos brancos) a produzirem anticorpos (principalmente IgA) que podem ser medidos no sangue, através de testes sorológicos.

Uma das respostas imunológicas diante de um organismo estranho é a resposta de mucosa, ou seja, o revestimento do intestino, trato reprodutivo e tecido mamário, que formam uma barreira física contra a infecção. Neste caso, os linfócitos presentes imediatamente abaixo da superfície liberam os anticorpos (IgM e IgG) que funcionam localmente contra organismos estranhos que podem se ligar à superfície.