O SIAFI pode ser utilizado pelas entidades públicas federais, estaduais e municipais apenas para acompanhar, pela conta única do governo federal, suas despesas de custeio.

Para utilizar o SIAFI o usuário precisa ser funcionário público federal devidamente cadastrado e habilitado no sistema e de posse de uma senha comum para os servidores federais.

O SIAFI é um sistema informatizado que processa e controla, por meio de terminais instalados em todo o território nacional, apenas assuntos relacionados a execução orçamentária e financeira.

Entidades de caráter privado também podem utilizar o SIAFI, desde que autorizadas pela STN. No entanto, essa utilização depende da celebração de convênio ou assinatura de termo de cooperação técnica entre os interessados e a STN, que é o órgão gestor do SIAFI.

O Órgão Central de Programação Financeira é a Coordenação-Geral de Programação Financeira - COFIN, da Secretaria de Planejamento e Orçamento, os Órgãos Setoriais de Programação Financeira - OSPF são as Subsecretarias do Tesouro Nacional – STN e unidades equivalentes das Secretarias da Presidência da República e dos Poderes Legislativo e Judiciário, enquanto que os Órgãos Setoriais são as Unidades Gestoras.