No rebanho bovino, o primeiro sítio de infecção viral e subsequente rápida multiplicação são as glândulas mamárias. Após poucos dias de viremia, o vírus aparece no leite e na saliva por até 72 horas antes das vesículas surgirem na boca.

O agente é eliminado por quantidade tão elevadas que um só animal pode infectar a outros milhares.

O período de infectividade máxima é quando as vesículas estão drenando, e o liquido vesicular contém o vírus em concentração máxima.

O vírus é eliminado para o meio ambiente em todas as secreções e excreções dos bovinos doentes (lágrima, secreções nasais, saliva, sêmen, leite, urina e fezes), contaminando o meio ambiente.

Uma conjunção de baixa temperatura, alta umidade e ventos moderados favorecem sobremaneira a difusão do vírus, que pode alcançar locais distantes até 10km do foco original.