Na tecnologia da transgenia são inseridos genes que dependem de um produto químico para voltar a ter funcionalidade. Uma vantagem do uso de transgênicos que deve ser ressaltada é que, nesta situação, os produtores não são obrigados a pagar royalties a cada compra de sementes, o que diminui os custos de produção.

Sementes e agrotóxicos sempre configuraram no mesmo setor de produção, por isso é comum que empresas que dominem o mercado de agrotóxicos também dominem a produção de sementes geneticamente modificadas.

O uso intensivo do glifosato em plantações transgênicas configura um sério problema de risco ao meio ambiente pela contaminação do solo, da água e dos seres vivos, contudo ainda não surgiram pragas que apresentam algum grau de resistência a este herbicida.

Plantas transgênicas resistentes aos herbicidas diminuem o grau de dependência dos agricultores aos agrotóxicos.

A trajetória que levou à imbricação entre transgênico e agrotóxico é o resultado do modelo tecnológico hegemônico que considera o agrotóxico o único caminho para aumentar a produtividade agrícola.