O bacilo microaerófilo Gram-negativo que reside na camada mucosa gástrica e causa infecção gástrica e inflamação crônica é o Helicobacter pylori.

Os sintomas normalmente aliviam logo depois que o estômago se esvazia, onde há diminuição na produção de ácido gástrico.

O H. pylori está associado com 50 a 60% das úlceras duodenais e com 70 a 90% das úlceras gástricas.

As células parenquimatosas do estômago produzem uréase, uma enzima que quebra a ureia, aumentando o pH local e inibindo o meio ácido.