Ointroito vaginal e a uretra distal são colonizados, normalmente, por bacilos gram-positivos e por bacilos entéricos gram-negativos que causam, comumente, as infecções do trato urinário.

Como as secreções prostáticas não tem propriedade antibacteriana, a próstata é frequentemente acometida no homem adulto.

A Escherichia coli causa cerca de 80% das infecções agudas, (tanto cistite, como pielonefrite) nos pacientes sem cateteres, anormalidades urológicas ou cálculos.

Não há evidência epidemiológica da associação da perda de parte da flora vaginal de lactobacilos produtores de H202 e a colonização por Escherichia coli

Na maioria das infecções do trato urinário, as bactérias alcançam a bexiga, por via hematogênica, ocorrendo a seguir a infecção por via ascendente.