A primeira fase no processo de degradação anaeróbia consiste na hidrólise de substâncias particuladas complexas em substâncias dissolvidas mais simples, as quais podem, dessa forma, atravessar a membrana celular das bactérias fermentativas.

A etapa final do processo de degradação anaeróbia, ou seja, em que ocorre a transformação da matéria orgânica em gás metano e gás carbônico, é efetuada pelas chamadas bactérias acetogênicas.

A velocidade das reações bioquímicas, tanto na decomposição anaeróbia quanto na aeróbia, é altamente dependente da temperatura do ambiente onde ocorre a digestão.

A velocidade das reações bioquímicas em ambientes anaeróbios é bem menor do que em ambientes aeróbios.

O gás produzido em maior proporção na decomposição anaeróbia é o metano (CH4) que, inclusive, pode ser utilizado como combustível para motores a explosão.