A taxa de aplicação de carga orgânica é volumétrica, deve manter, pelo menos, !$ 100g DBO/m^3 !$.dia, de modo a manter a lagoa totalmente anaeróbia, e não a mais que !$ 400g DBO/m^3 !$.dia, para evitar a emissão de maus odores.

O tempo de detenção hidráulico deve ser suficiente para sedimentação de sólidos e para degradação anaeróbia da matéria orgânica solúvel, sendo, no mínimo, de 6 dias e, no máximo, 10 dias nas lagoas anaeróbias para esgoto doméstico, tempo necessário para a geração das bactérias formadoras do metano.

Recomenda-se projetar uma lagoa mais profunda, com 3 a 4 metros de profundidade.