O Marco Lógico deve demonstrar a compatibilidade lógica entre, sucessivamente, a finalidade (impacto da ação governamental), o objetivo, os produtos e as atividades.

A estrutura do Marco Lógico corresponde a uma matriz de quatro por quatro, onde as linhas apresentam informações acerca dos objetivos, indicadores, meios de verificação e pressupostos em quatro momentos diferentes da vida de um projeto ou programa governamental.

Os passos a serem seguidos na elaboração do Marco Lógico são: definição da finalidade; descrição do objetivo do programa; identificação dos produtos; e listagem das atividades.

O Marco Lógico é sempre um método participativo, não podendo ser construído apenas por técnicos, baseando-se nas informações e nos documentos existentes sobre um programa.

O Marco Lógico exige que se identifiquem as informações a respeito dos indicadores, pois obriga o avaliador a localizar as fontes de informações existentes ou planejar a forma de coleta dessas informações.