A incapacidade da cobaia Cavia porcellus de sintetizar o ácido ascórbico resulta na necessidade de suplementação exógena de vitamina C, sendo que sua deficiência pode ser responsável pela redução no consumo de alimentos, perda de peso, anemia e hemorragia generalizada, podendo levar o indivíduo à morte em menos de 4 semanas.

Os programas de acasalamento de cobaias podem ser monogâmicos ou poligâmicos, sendo recomendado o acasalamento poligâmico, por apresentar a vantagem de produzir maior número de animais com menor necessidade de espaço, bem como proporcionar melhor controle de registo genealógico e facilitar a identificação das fêmeas e dos machos inférteis.

O controle reprodutivo em cobaias é importante para o controle de consanguinidade da colônia, sendo que o acasalamento isogênico (ou inbred) consiste na técnica de acasalar indivíduos de constituição genética variada, em estado de heterozigose, em que se evita o acasalamento entre indivíduos com parentesco próximo.

A escolha da espécie a ser criada como cobaia deve ser baseada em características como fácil adaptação a diferentes ambientes, fácil manejo, docilidade, pequeno porte, baixo consumo alimentar, fisiologia conhecida, baixa prolificidade e ciclo reprodutivo curto.

Os indivíduos da espécie mus musculus e rattus novergicus não apresentam comportamento de hierarquia social definido, de modo que a troca de machos reprodutores entre colônias pode ser realizada sem riscos à integridade física desses indivíduos.