A seleção e padronização de medicamentos ocorre por meio de um processo dinâmico, contínuo, multidisciplinar e participativo.

A especificação de um medicamento deve incluir: dosagem, forma farmacêutica, volume e/ou peso e nomenclatura do fármaco segundo a Denominação Comum Brasileira – DCB, cuja terminologia empregada na sua descrição deve ser entendida por usuários e fornecedores.

A ordenação do estoque pode seguir diferentes modos: Por ordem alfabética; Por forma farmacêutica; Pela Curva ABC de consumo ou valor.

Para implementar a seleção de medicamentos faz-se obrigatório a instalação de uma Comissão de Farmácia e Terapêutica, que é uma equipe multidisciplinar composta por médicos, enfermeiros, farmacêuticos, administradores e demais profissionais envolvidos.

A padronização facilita os processos de aquisição, armazenamento, distribuição e gerenciamento do estoque, pois racionaliza a quantidade de itens.