Frascos de agentes desidratantes devem ser mantidos bem fechados e não devem ser abertos frequentemente, por causa da sua natureza higroscópica.

Como agente desidratante, a acetona é superior ao etanol porque este álcool absorve a água da atmosfera e interfere na fixação de lipídios da célula, causando artefatos.

Os agentes desidratantes mais utilizados são etanol e acetona, e permitem que a água da célula da amostra seja substituída gradualmente, numa porcentagem decrescente.

Os agentes desidratantes podem extrair lipídios da amostra, e para evitar que as gotas lipídicas se tornem não-homogêneas ou percam sua densidade de elétrons, faz-se o uso de acetato de uranila.

Estratégias de hidratação do etanol por peneiras moleculares podem acarretar dificuldades durante a ultramicrotomia, por dano à navalha de vidro ou diamante.