Para avaliar a distribuição quantitativa das menores frações do plâncton, picoplâncton (0,2 a 2 microns) e nanoplâncton (2 a 20 microns), deve-se conhecer o volume exato de água, as amostras devem ser discretas e pequenas e o aparato de coleta deve ser de fácil manuseio. O equipamento mais eficaz para a coleta desses organismos e a sua justificativa de utilização são, respectivamente: