Foi criada pela FAO, OMS e Agência Nacional de Vigilância Sanitária com o objetivo de estabelecer padrões para alimentos, guias e textos relacionados, tais como códigos de práticas.

É grande a preocupação com o aumento da ocorrência de doenças transmitidas por alimentos, sobretudo em relação aos patógenos emergentes e reemergentes veiculados por produtos alimentícios.

O Brasil é signatário do Codex, mas não tem participação ativa em suas reuniões, realizadas periodicamente sob os auspícios da OMS.

Esse programa visa proteger a saúde dos consumidores e assegurar práticas justas no comércio, além de coordenar todas as atividades de padronização de produtos alimentícios acordados pelas organizações internacionais e nacionais, se governamentais.