o CHKDSK funciona em um volume NTFS.

os sistemas de arquivo FAT e FAT32, não têm registro de transações. Se o disco apresentar defeito –devido a uma queda brusca e rápida de alimentação elétrica, por exemplo - antes de concluída uma gravação, e o disco ser reinicializado, não haverá nenhum registro da última estrutura válida do disco e será necessário executar o CHKDSK.

e o CHKDSK encontrar um setor defeituoso, ele assinalará a localização deste setor no relatório do volume. Se o setor fizer parte de um cluster que estava sendo usado, o CHKDSK não conseguirá recuperar esses dados.