Descontaminação e desinfecção são sinônimos.

A descontaminação tem por finalidade reduzir o número de microrganismos presentes nos artigos sujos, de forma a torná-los seguros para manuseá-los, isto é, ofereçam menor risco ocupacional.

O uso de agentes químicos desinfetantes como glutaraldeído, formaldeído, hipoclorito de sódio e outros, no processo de descontaminação, prática largamente utilizada, não tem fundamentação.

O agente químico é impedido de penetrar nos microrganismos, pois há tendência das soluções químicas ligarem-se com as moléculas de proteínas presentes na matéria orgânica, não ficando livres para ligarem-se aos microrganismos nas proporções necessárias dando uma “falsa segurança” no manuseio do material como descontaminado.

O uso desses agentes na prática da descontaminação causa uma aderência de precipitado de matéria orgânica no artigo, prejudicando sobremaneira a posterior limpeza.