O hidrogênio é a principal fonte de sinal na maioria dos exames de ressonância magnética pois o núcleo do hidrogênio consiste em um único próton, possui spin e momento magnético, além da maior concentração nos tecidos e de seu maior momento magnético, o sinal obtido do hidrogênio é superior a 1000 vezes em relação a qualquer outro elemento presente nos tecidos do corpo de animais.