Mesmo quando pensamentos disfuncionais são sujeitos à reflexão objetiva, as emoções, o comportamento e a reação fisiológica do sujeito não conseguem ser modificadas.

Os pensamentos automáticos, mesmo muito rápidos e breves, são sempre perceptíveis pelo indivíduo.

Os terapeutas cognitivo-comportamentais estão particularmente interessados no nível de pensamento que pode operar simultaneamente com um pensamento mais óbvio, de nível mais superficial.

Parte da hipótese de que as emoções, os comportamentos e a fisiologia de uma pessoa são influenciados pelas situações vivenciadas.