Análise comparativa de proteínas e de ácidos nucleicos tem confirmado as semelhanças anatômicas e embrionárias já verificadas em certos organismos. Um exemplo é a comparação de sequências de aminoácidos do Citocromo c, presentes na maioria das espécies. Quando comparado o Citocromo c humano com outros animais, nota-se:

1. em chimpanzés eles são exatamente os mesmos;
2. em baleias eles se diferem quanto à posição de 8 aminoácidos;
3. em peixes eles se diferem quanto à posição de 20 aminoácidos; e,
4. em aves eles se diferem quanto à posição de 13 aminoácidos.

De acordo com o evolucionismo, essa diferença reflete nosso maior grau de parentesco com: