Quanto à fisiopatologia, o envolvimento do estresse oxidativo e a produção de catecolaminas não tem relação com o desenvolvimento da resistência à insulina e à obesidade.

A síndrome da apneia obstrutiva do sono é um fator de risco para morbidade e mortalidade cardiovascular, relacionada a hipoxemia intermitente, retenção de CO₂ causando alteração das respostas hemodinâmicas e autonômicas durante o sono.

A prevalência na população da síndrome da apneia obstrutiva do sono é semelhante entre homens e mulheres, sendo o mais conhecido e tratado transtorno respiratório do sono.

A fisiopatologia relacionada aos transtornos respiratórios e ao acidente vascular encefálico está relacionada à redução da resposta inflamatória da interleucina 6, da proteína c reativas e do amiloide a sérico.

No que diz respeito às alterações hemodinâmicas, estudos sobre o fluxo cerebral sanguíneo durante as apneias sugerem uma redução da pressão intracraniana durante as pausas obstrutivas.