Eletroforese é um método quantitativo que permite identificar número de fragmentos de DNA contidos em uma amostra.

O protocolo padrão de gel de agarose permite separar fragmentos de DNA entre 0,5 a 25 kb. Porém a eletroforese limita-se somente a separação de ácidos nucléicos como DNA e RNA.

A agarose utilizada no gel é uma glicoproteína que forma uma rede e permite regular a velocidade da migração das moléculas durante a separação.

Eletroforese em gel de agarose é um método simples e eficiente que permite separação, identificação e purificação de moléculas de DNA. As moléculas são separadas através da migração de partículas no gel, com a aplicação de uma diferença de potencial elétrico, onde as moléculas de menor massa migram mais rápido de DNA.

A velocidade de migração das moléculas é proporcional ao campo elétrico e ao seu volume molecular.