Os peptidoglicanos, presentes em bactérias exclusivamente gram-negativas, são liberados durante a lise celular ou o processo de divisão bacteriana. O lipídio A, uma porção da molécula, é a principal responsável pelos efeitos biológicos desses peptidoglicanos.

Entre os componentes estruturais particularmente en contrados nas bactérias gram-positivas podem ser citados os lipopolissacarídeos, responsáveis pelo efeito pró-inflamatório.

Os ácidos lipoteicoico apresentam propriedades de adesão ao dente por sua atividade adsortiva à hidroxiapatita, ligando-se por meio de sua porção lipídica.

Os produtos bacterianos típicos de bactérias gram-negativas são as capsulas, responsáveis pela proteção, enquanto os comuns a ambas as bactérias são as vesículas extracelulares.

As fímbrias, presentes em ambos os tipos de bactérias, são potentes estimuladoras da resposta inata do sistema imunológico do hospedeiro. Elas induzem uma série de eventos biológicos que culminam em uma resposta inflamatória.