O período de incubação para a transmissão adquirida intra-útero não é conhecido. Entretanto, sabe-se que a transmissão dessa infecção para o feto no primeiro trimestre de gestação é de 10% e atinge valores de 70% a 90% no terceiro trimestre.

Os sintomas, quando presentes, podem ser inespecíficos e devem fazer parte do diagnóstico diferencial das outras infecções de transmissão intrauterina.

Apesar do quadro clínico da toxoplasmose congênita ser muito variável, desde uma infecção grave fulminante a casos moderados e subclínicos, o acometimento neurológico não necessariamente está presente nos casos leves.

As lesões oculares primárias da toxoplasmose congênita são localizadas na retina e na coróide.

São achadas frequentes do sistema nervoso central, calcificações intracranianas, microcefalias, e hidrocefalias.