Poluição urbana e doméstica: provocada pela descarga de efluentes domésticos não tratados na rede hidrográfica, fossas sépticas e lixeiras. Este tipo de poluição, ao atingir o aquífero, origina um aumento da mineralização, elevação da temperatura, aparecimento de cor, sabor e odor desagradáveis.

Poluição agrícola: os contaminantes potencialmente mais significativos neste campo são os fertilizantes, pesticidas e indiretamente as práticas de irrigação. A reciclagem e a reutilização da água subterrânea para irrigação provocam um aumento progressivo da concentração de sais que, ao longo do prazo, a inutiliza para estes fins.

Poluição industrial: gera resíduos que, quando despejados nos corpos d’água sem nenhum controle ou tratamento, podem levar a sérios problemas de contaminação de mananciais. Dentre as indústrias poluentes destacam-se as alimentares, as metalúrgicas, as petroquímicas, as nucleares, as mineiras, as farmacêuticas, as eletroquímicas, as de fabricação de pesticidas e inseticidas.

Poluição por fármacos: ocasionada pelos medicamentos de uso veterinário; geralmente é mais intensa, já que a excreção é feita diretamente para o ambiente sem qualquer tratamento prévio. As principais vias de contaminação de fármacos ao meio ambiente ocorrem do seu uso intencional, em que são eliminados por excreção após o consumo oral, injeção ou infusão; da remoção de medicação de uso tópico durante o banho; e o descarte de medicamentos vencidos ou não mais desejados no esgoto ou no lixo.