Todo o instrumental utilizado nas atividades de necropsia deve ser bem lavado após o uso, preferencialmente em água corrente quente ou fria, utilizando-se escova com cerdas de náilon e detergente neutro. Preconiza-se fazer, em seguida, a esterilização por métodos químicos e/ou físicos.

A esterilização por calor seco pode ser alcançada pelo tratamento com temperatura usual de 150°C, a um tempo contínuo de 90 minutos, que é alcançada pelo uso do equipamento denominado