A disfagia orofaríngea e a aspiração aumentam o risco de infecções pulmonares, a desnutrição e a mortalidade. Em casos de penetração, definida como presença de saliva ou alimento abaixo do nível das pregas vocais, muitas vezes ocorrem complicações pulmonares e nutricionais elevando o grau de enfermidade e mortalidade nessa população.

A traqueostomia pode impor limitações morfofuncionais ao processo de deglutição devido à obstrução esofageana, além de redução da pressão respiratória subglótica e da elevação e da anteriorização da laringe. É considerada fator de alto risco para a broncoaspiração, que geralmente é silente; ou seja, sem sinais clínicos, principalmente sem uso de cuff.

O uso prolongado de ventilação mecânica pode acarretar incoordenação entre deglutição e respiração e prejuízos, como: alteração no trânsito oral e na formação do bolo; retardo do disparo de deglutição; resíduos em faringe e recessos piriformes; aumento da adução glótica durante a deglutição; diminuição da elevação laríngea; dessensibilização da faringe e da laringe.

A presença do tubo orotraqueal por tempo superior a 48 horas pode alterar mecanorreceptores e quimiorreceptores da mucosa faríngea e laríngea, causando alteração no reflexo de deglutição e transtornos na função laríngea, modificando a competência glótica, comprometendo mecanismos protetores e aumentando o risco de invasão de alimentos e saliva nas vias respiratórias.