A hematoxilina é considerada um corante ácido por reagir com o ácido nucleico dos núcleos celulares, e a eosina é um corante neutro por combinar grupamentos teciduais de cargas elétricas positivas e negativas.

A hematoxilina cora os núcleos celulares com tons de vermelho, e a eosina cora os citoplasmas celulares com tons de azul.

A hematoxilina cora os núcleos celulares com a cor violeta escuro, e a eosina cora os citoplasmas e a matriz extracelular com tons distintos de vermelho.

A hematoxilina cora os componentes acidófilos com a cor violeta, e a eosina cora os componentes basofílicos com tons distintos de azul.